注册分公司物流公司的流程如下：

确定公司名称：

选择一个符合规定且未被注册的公司名称。

办理道路运输许可证：

由于物流公司涉及道路运输，需在注册前办理道路运输许可证，并提供至少一名人员的驾驶证和从业资格证。

法定代表人、股东及注册资金认证登记：

确定公司的法定代表人及股东，并进行认证登记。

确定注册资金，并按照公司章程规定进行认缴。

前往银行办理注册手续：

携带相关证件前往银行开设公司验资账户，并存入注册资金进行验资。

工商行政部门登记：

携带所有必要证件前往工商行政部门进行公司登记。

办理公司基本账户和纳税账户：

在工商行政部门登记完成后，前往银行办理公司的基本账户和纳税账户。

注意事项： 在整个注册过程中，需确保所有提供的证件和信息真实有效。 注册分公司物流公司还需考虑总公司的相关规定和流程，确保分公司与总公司的业务协同和合规性。 具体注册流程可能因地区和政策差异而有所不同，建议在注册前咨询当地工商行政管理部门或专业服务机构以获取准确信息。